Covid-19: Risques de contamination par le SRAS-CoV-2 chez les animaux

L’Organisation des Nations Unies pour l’alimentation et l’agriculture (FAO), l’Organisation mondiale de la santé animale (OIE) et l’Organisation mondiale de la santé (OMS) dans une Déclaration conjointe ce 7 mars 2022, attirent l’attention sur la priorisation de la surveillance de l’infection par le SRAS-CoV-2 chez les animaux sauvages et la prévention de la formation de réservoirs animaux.

 

Alors que le monde entier aborde la troisième année de la pandémie, le SRAS-CoV-2, le virus qui cause le COVID-19, se propage entre les personnes à un niveau intense dans le monde. De nombreux facteurs influencent la transmission. L’un d’entre eux est l’émergence de variantes hautement transmissibles préoccupantes, la dernière en date étant Omicron. Le virus continue d’évoluer et le risque d’émergence future de variants est élevé.

Les animaux menacés

Selon la déclaration, bien que la pandémie de COVID-19 soit provoquée par une transmission interhumaine, le virus SARS-CoV-2 est également connu pour infecter des espèces animales. Les connaissances actuelles indiquent que la faune sauvage ne joue pas un rôle significatif dans la propagation du SRAS-CoV-2 chez l’homme, mais la propagation dans les populations animales peut affecter la santé de ces populations et peut faciliter l’émergence de nouvelles variantes du virus.

En plus des animaux domestiques, des animaux sauvages en liberté, en captivité ou d’élevage tels que les grands félins, les visons, les furets, les cerfs de Virginie d’Amérique du Nord et les grands singes ont jusqu’à présent été observés comme étant infectés par le SARS-CoV-2. À ce jour, souligne la déclaration, il a été démontré que les visons d’élevage et les hamsters de compagnie sont capables d’infecter les humains avec le virus SARS-CoV-2 et un cas potentiel de transmission entre le cerf de Virginie et un humain est actuellement à l’étude.

L’introduction du SRAS-CoV-2 dans la faune pourrait donc entraîner la création de réservoirs animaux. Par exemple, il a été signalé qu’environ un tiers des cerfs de Virginie sauvages aux États-Unis d’Amérique ont été infectés par le SRAS-CoV-2, initialement via plusieurs événements de transmission d’homme à cerf. Les lignées SARS-CoV-2 détectées chez le cerf de Virginie ont également circulé dans les populations humaines proches. Il a été démontré que les cerfs de Virginie excrètent le virus et le transmettent entre eux.

La FAO, l’OIE et l’OMS appellent tous les pays à prendre des mesures pour réduire le risque de transmission du SRAS-CoV-2 entre l’homme et la faune dans le but de réduire le risque d’émergence de variantes et de protéger à la fois l’homme et la faune. Nous exhortons les autorités à adopter les réglementations pertinentes et à diffuser les recommandations précédemment publiées par la FAO, l’OIE et l’OMS (1) aux personnes travaillant en contact étroit avec ou manipulant des espèces sauvages, y compris les chasseurs et les bouchers ; et (2) le public.

Le personnel travaillant en étroite collaboration avec la faune sauvage doit être formé pour mettre en œuvre des mesures qui réduisent le risque de transmission entre les personnes et entre les personnes et les animaux, en utilisant les conseils de l’OMS sur la façon de se protéger et de prévenir la propagation du COVID-19, et les directives de l’OIE et de la FAO sur l’utilisation des équipements de protection individuelle (EPI) et des bonnes pratiques d’hygiène autour des animaux, y compris les bonnes pratiques d’hygiène pour les chasseurs et les bouchers.

Les humains ne sont pas infectés en mangeant de la viande

Les preuves actuelles suggèrent que les humains ne sont pas infectés par le virus SARS-CoV-2 en mangeant de la viande. Cependant, mentionne la déclaration, les chasseurs ne doivent pas suivre les animaux qui semblent malades ni récolter ceux qui sont trouvés morts. Des techniques d’abattage et de préparation des aliments appropriées, y compris des pratiques d’hygiène appropriées, peuvent limiter la transmission des coronavirus, y compris le SRAS-CoV-2, et d’autres agents pathogènes zoonotiques.

Recommandations

La FAO, l’OIE et l’OMS soulignent que le public doit être informé des contacts avec la faune sauvage. Certains animaux sauvages peuvent s’approcher des établissements humains et des zones résidentielles. «  Par mesure de précaution générale, les gens ne doivent pas approcher ou nourrir les animaux sauvages ou toucher ou manger ceux qui sont orphelins, malades ou retrouvés morts (y compris les victimes de la route) », indique la déclaration. Autrement, les signataires recommandent de contacter les autorités locales de la faune ou un professionnel de la santé de la faune. Les organisations recommandent également l’élimination en toute sécurité des aliments non consommés, les masques, les mouchoirs et tout autre déchet humain pour éviter d’attirer la faune, en particulier dans les zones urbaines et, si possible, éloigner les animaux domestiques de la faune et de leurs excréments.

La FAO, l’OIE et l’OMS encouragent en outre les services nationaux de santé animale et humaine des pays à privilégier la collaboration entre les services vétérinaires nationaux et les autorités nationales de la faune, dont le partenariat est essentiel pour promouvoir la santé animale et préserver la santé humaine et environnementale ; promouvoir la surveillance de la faune et encourager l’échantillonnage d’animaux sauvages connus pour être potentiellement sensibles au SRAS-CoV-2 ; partager toutes les données de séquence génétique des études de surveillance animale via des bases de données accessibles au public ; signaler les cas animaux confirmés de SRAS-CoV-2 à l’OIE par le biais du Système mondial d’information zoosanitaire (OIE-WAHIS) ; créer des messages sur le SRAS-CoV-2 chez les animaux avec soin afin que les perceptions publiques inexactes n’aient pas d’impact négatif sur les efforts de conservation ; Suspendre la vente de mammifères sauvages vivants capturés sur les marchés alimentaires en tant que mesure d’urgence. « Aucun animal infecté par le SRAS-CoV-2 ne doit être abandonné, rejeté ou tué sans fournir de justification à partir d’une évaluation des risques spécifique au pays ou à l’événement » prévient la déclaration.

Les organisations sus-citées soulignent l’importance de surveiller les populations de mammifères sauvages pour l’infection par le SRAS-CoV-2, de communiquer les résultats aux Services vétérinaires nationaux (qui signalent ces résultats à l’OIE) et de partager les données de séquençage génomique sur des bases de données accessibles au public. Les pays doivent également adopter des précautions pour réduire le risque d’établissement de réservoirs animaux et l’accélération potentielle de l’évolution du virus chez de nouveaux hôtes, ce qui pourrait conduire à l’émergence de nouvelles variantes du SRAS-CoV-2. De telles mesures préserveront la santé de la faune précieuse ainsi que celle des humains, concluent-elles.

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